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<NBS8217> ApeKI

欄目:NoninBio
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ApeKI來(lái)源于超嗜熱需氧古生菌(Aeropyrum pernix) K1,屬于Type IIP型限制酶,識(shí)別并切割G/CWGC序列,形成3堿基突出的粘性末端。ApeKI是基因組簡(jiǎn)化測(cè)序(genotyping-by-sequencing,GBS)的首選酶之一,此外,還廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物遺傳研究、群體進(jìn)化分析及功能基因定位等領(lǐng)域。

識(shí)別位點(diǎn):
GCWGC
5'...G↓C W G C...3'
3'...C G W C↑G ...5'

同裂酶:TseI
注:同裂酶對(duì)于不同的甲基化修飾可能具有不同敏感性。

 

ApeKI

 

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱

包裝規(guī)格

價(jià)格

NBS8217

ApeKI

500 U

300


產(chǎn)品簡(jiǎn)介:

ApeKI來(lái)源于超嗜熱需氧古生菌(Aeropyrum pernix) K1,屬于Type IIP型限制酶,識(shí)別并切割G/CWGC序列,形成3堿基突出的粘性末端。ApeKI是基因組簡(jiǎn)化測(cè)序(genotyping-by-sequencingGBS)的首選酶之一,此外,還廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物遺傳研究、群體進(jìn)化分析及功能基因定位等領(lǐng)域。

 

識(shí)別位點(diǎn):

GCWGC
5'...G↓C W G C...3'
3'...C G W C↑G ...5'

同裂酶:TseI

注:同裂酶對(duì)于不同的甲基化修飾可能具有不同敏感性。

 

產(chǎn)品組成:

組分

規(guī)格

ApeKI (10 U/μl)

50 μl

10× Cut Buffer C

1 ml

10× FastCut Buffer

1 ml

10× FastCut Color Buffer

1 ml

 

保存條件

-20℃保存,2年有效。

 

建議反應(yīng)條件:

1× Cut Buffer C
75℃
溫育;
參照“DNA 酶切流程配制反應(yīng)體系。

 

失活條件:

不可熱失活,請(qǐng)使用酚氯仿抽提或柱純化。

 

甲基化敏感性:

對(duì)于被 CpG 甲基化的 DNA,剪切可能受阻。

 

活性定義:

1 活性單位 (U) 是指在 50 μl 反應(yīng)體系中,75℃ 1 h內(nèi)完全酶切 1 μg λDNA 所需的酶量。

 

功能活性檢測(cè):

75℃下,10 U ApeKI能夠在15 min內(nèi)完全消化1 μg λDNA

 

超長(zhǎng)時(shí)間溫育檢測(cè):

75℃下,將10 U ApeKI1 μg λDNA共同溫育3 h,未檢測(cè)到其他核酸酶污染或星號(hào)活性引起的底物非特異性降解。延時(shí)酶切可能出現(xiàn)星號(hào)活性。

 

酶切-連接-再酶切檢測(cè):

75 ℃下,使用10 U ApeKI消化底物,回收酶切產(chǎn)物。在22℃下使用適量 T4 DNA Ligase (Fast)可以將酶切產(chǎn)物重新連接。將連接產(chǎn)物再次回收后,使用相同的內(nèi)切酶可以重新切開(kāi)連接產(chǎn)物。

 

使用方法:

1. DNA酶切流程

在冰上按如下建議的加樣順序配制反應(yīng)體系:

ddH2O

up to 50μl

10× Cut Buffer C

5μl

底物DNAa

1μg

ApeKI (10 U/μl)

1μl

Total

50μl

a. DNA 底物中應(yīng)不含苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、洗滌劑或高濃度鹽,否則將會(huì)影響ApeKI酶活性;

輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時(shí)離心以收集掛壁液滴;

③ 75℃溫育15 min~3 h

酚氯仿抽提或柱純化(可選)。

 

不同DNA中的酶切位點(diǎn)數(shù)量

λDNA

ΦX174

pBR322

pUC57

pUC18/19

SV40

M13mp18/19

Adeno2

199

14

21

12

12

22

1

179

 

甲基化修飾影響

Dam

Dcm

CpG

EcoKI

EcoBI

無(wú)影響

無(wú)影響

剪切受阻

無(wú)影響

無(wú)影響

 

在不同反應(yīng)緩沖液中的活性


FastCut

Buffer

Thermo Scientific

FastDigest Buffer

NEB

rCutSmart? Buffer

Takara

QuickCut? Buffer

活性

12.5%

50%

12.5%

2%

注:活性數(shù)據(jù)來(lái)自限制酶標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系下的檢測(cè)。

 

注意事項(xiàng):

1.      反應(yīng)體系中加入的酶體積不應(yīng)超過(guò)總體積的10%,避免酶中過(guò)多的甘油引起星號(hào)活性;

2.      限制性內(nèi)切酶存儲(chǔ)緩沖液中的添加劑(例如甘油、鹽)與底物溶液中的污染物(例如鹽、EDTA或乙醇等)相同,反應(yīng)體積越小,酶切反應(yīng)抑制效應(yīng)越強(qiáng)。

3.      為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。

 

本產(chǎn)品僅用于生命科學(xué)研究,不得用于醫(yī)學(xué)診斷及其他用途!

相關(guān)常規(guī)限制性內(nèi)切酶產(chǎn)品:

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱

包裝規(guī)格

NBS8216

AarI

100 U

NBS8217

ApeKI

500 U

NBS8218

BbvCI

50 U

NBS8219

BpiI

250 U

NBS8220

BsiWI

300 U

NBS8221

BsmBI

200 U

NBS8222

BspQI

500 U

NBS8223

BsrDI

250 U

NBS8224

BstXI

500 U

NBS8225

PciI

200 U

NBS8226

Sgel

250 U

NBS8227

SgrAI

500 U

NBS8228

SspDI (KasI)

250 U

NBS8229

SwaI

1000 U

NBS8230

XmnI

500 U


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