ApeKI
產(chǎn)品編號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 包裝規(guī)格 | 價(jià)格 |
NBS8217 | ApeKI | 500 U | 300 |
產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
ApeKI來(lái)源于超嗜熱需氧古生菌(Aeropyrum pernix) K1,屬于Type IIP型限制酶,識(shí)別并切割G/CWGC序列,形成3堿基突出的粘性末端。ApeKI是基因組簡(jiǎn)化測(cè)序(genotyping-by-sequencing,GBS)的首選酶之一,此外,還廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物遺傳研究、群體進(jìn)化分析及功能基因定位等領(lǐng)域。
識(shí)別位點(diǎn):
GCWGC
5'...G↓C W G C...3'
3'...C G W C↑G ...5'
同裂酶:TseI
注:同裂酶對(duì)于不同的甲基化修飾可能具有不同敏感性。
產(chǎn)品組成:
組分 | 規(guī)格 |
ApeKI (10 U/μl) | 50 μl |
10× Cut Buffer C | 1 ml |
10× FastCut Buffer | 1 ml |
10× FastCut Color Buffer | 1 ml |
保存條件:
-20℃保存,2年有效。
建議反應(yīng)條件:
1× Cut Buffer C;
75℃溫育;
參照“DNA 酶切流程”配制反應(yīng)體系。
失活條件:
不可熱失活,請(qǐng)使用酚氯仿抽提或柱純化。
甲基化敏感性:
對(duì)于被 CpG 甲基化的 DNA,剪切可能受阻。
活性定義:
1 活性單位 (U) 是指在 50 μl 反應(yīng)體系中,75℃ 1 h內(nèi)完全酶切 1 μg λDNA 所需的酶量。
功能活性檢測(cè):
75℃下,10 U ApeKI能夠在15 min內(nèi)完全消化1 μg λDNA。
超長(zhǎng)時(shí)間溫育檢測(cè):
75℃下,將10 U ApeKI與1 μg λDNA共同溫育3 h,未檢測(cè)到其他核酸酶污染或星號(hào)活性引起的底物非特異性降解。延時(shí)酶切可能出現(xiàn)星號(hào)活性。
酶切-連接-再酶切檢測(cè):
75 ℃下,使用10 U ApeKI消化底物,回收酶切產(chǎn)物。在22℃下使用適量 T4 DNA Ligase (Fast)可以將酶切產(chǎn)物重新連接。將連接產(chǎn)物再次回收后,使用相同的內(nèi)切酶可以重新切開(kāi)連接產(chǎn)物。
使用方法:
1. DNA酶切流程
① 在冰上按如下建議的加樣順序配制反應(yīng)體系:
ddH2O | up to 50μl |
10× Cut Buffer C | 5μl |
底物DNAa | 1μg |
ApeKI (10 U/μl) | 1μl |
Total | 50μl |
a. DNA 底物中應(yīng)不含苯酚、氯仿、乙醇、EDTA、洗滌劑或高濃度鹽,否則將會(huì)影響ApeKI酶活性;
② 輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時(shí)離心以收集掛壁液滴;
③ 75℃溫育15 min~3 h;
④ 酚氯仿抽提或柱純化(可選)。
不同DNA中的酶切位點(diǎn)數(shù)量
λDNA | ΦX174 | pBR322 | pUC57 | pUC18/19 | SV40 | M13mp18/19 | Adeno2 |
199 | 14 | 21 | 12 | 12 | 22 | 1 | 179 |
甲基化修飾影響
Dam | Dcm | CpG | EcoKI | EcoBI |
無(wú)影響 | 無(wú)影響 | 剪切受阻 | 無(wú)影響 | 無(wú)影響 |
在不同反應(yīng)緩沖液中的活性
FastCut Buffer | Thermo Scientific FastDigest Buffer | NEB rCutSmart? Buffer | Takara QuickCut? Buffer | |
活性 | 12.5% | 50% | 12.5% | 2% |
注:活性數(shù)據(jù)來(lái)自限制酶標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系下的檢測(cè)。
注意事項(xiàng):
1. 反應(yīng)體系中加入的酶體積不應(yīng)超過(guò)總體積的10%,避免酶中過(guò)多的甘油引起星號(hào)活性;
2. 限制性內(nèi)切酶存儲(chǔ)緩沖液中的添加劑(例如甘油、鹽)與底物溶液中的污染物(例如鹽、EDTA或乙醇等)相同,反應(yīng)體積越小,酶切反應(yīng)抑制效應(yīng)越強(qiáng)。
3. 為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
本產(chǎn)品僅用于生命科學(xué)研究,不得用于醫(yī)學(xué)診斷及其他用途!
相關(guān)常規(guī)限制性內(nèi)切酶產(chǎn)品:
產(chǎn)品編號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 包裝規(guī)格 |
100 U | ||
500 U | ||
50 U | ||
250 U | ||
300 U | ||
200 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
200 U | ||
250 U | ||
500 U | ||
250 U | ||
1000 U | ||
500 U |